במפעלים המאחסנים, מעבדים או מייצרים מחלב ומוצריו, משרד הבריאות נוקט במדיניות
מחמירה לשמירה על היגיינה. ניסיון העבר הראה כי אזורי הייצור רגישים לזיהום ובכך
יכולים להוות קרקע פוריה להתפתחות עובש, חיידקים ווירוסים. על מנת למנוע זאת, יש
להפקיד על ניהול תהליכי היגיינה קפדניים, תוך התייחסות לציוד, למכשור למשטחים
ולכח האדם בתהליך הייצור והאריזה, ובכך להבטיח איכות מוצר אופטימלית.